Knowledge

Deltacoronavirus

Source 📝

67: 1685: 42: 446:
Lau SKP, Wong EYM, Tsang CC, Ahmed SS, Au-Yeung RKH, Yuen KY, Wernery U, Woo PCY. Discovery and Sequence Analysis of Four Deltacoronaviruses from Birds in the Middle East Reveal Interspecies Jumping with Recombination as a Potential Mechanism for Avian-to-Avian and Avian-to-Mammalian Transmission.
355:
appears to be common among deltacoronaviruses. Recombination occurs frequently in the viral genome region that encodes the host receptor binding protein. Recombination between different viral lineages contributes to the emergence of new viruses capable of interspecies transmission and adaptation to
397:"Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus" 1188: 637: 1776: 1294: 925: 1679: 1789: 816: 1311: 1763: 17: 495: 468: 1688: 823: 1030: 395:
Woo PC, Lau SK, Lam CS, Lau CC, Tsang AK, Lau JH, Bai R, Teng JL, Tsang CC, Wang M, Zheng BJ, Chan KH, Yuen KY (2012).
1214: 1207: 1794: 1802: 1539: 1251: 758: 222: 860: 853: 1316: 1258: 1095: 751: 259: 66: 1415: 1244: 1025: 1830: 1560: 488: 243: 1741: 1807: 1199: 370: 324: 1532: 1288: 1123: 215: 199: 1553: 447:
J Virol. 2018 Jul 17;92(15):e00265-18. doi: 10.1128/JVI.00265-18. Print 2018 Aug 1. PMID 29769348
236: 1840: 1781: 1703: 1452: 1304: 1194: 1181: 1102: 1087: 918: 481: 1835: 1459: 630: 352: 1684: 61: 8: 375: 49: 1109: 1082: 1020: 1015: 567: 421: 396: 309: 163: 1750: 1546: 1445: 1076: 426: 229: 53: 1362: 577: 416: 408: 295: 283: 1755: 349:, the gamma and delta genera are derived from the avian and pig viral gene pools. 1726: 1115: 1051: 548: 536: 289: 127: 473: 320: 1824: 1373: 737: 653: 524: 506: 315: 151: 103: 1576: 1518: 1274: 1167: 904: 876: 802: 774: 681: 530: 430: 252: 208: 115: 1735: 1617: 1490: 1401: 1230: 1139: 1062: 997: 969: 941: 839: 709: 616: 588: 542: 412: 304: 192: 139: 1768: 1431: 1341: 1299: 346: 518: 365: 331: 328: 91: 1697: 460: 1720: 1321: 469:
Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR): Coronaviridae
1336: 1331: 1326: 339: 278: 78: 41: 335: 345:
While the alpha and beta genera are derived from the
1189:
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
638:
Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
503: 1822: 926:NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b 1629: 489: 394: 817:Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013 1638: 496: 482: 40: 788:Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011 442: 440: 420: 14: 1823: 565: 437: 1702: 1701: 1614: 564: 477: 824:Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398 1153:Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 1031:Transmissible gastroenteritis virus 334:. Deltacoronaviruses infect mostly 24: 25: 1852: 1215:Tylonycteris bat coronavirus HKU4 1208:Pipistrellus bat coronavirus HKU5 454: 1683: 1540:Common moorhen coronavirus HKU21 1252:Rousettus bat coronavirus GCCDC1 890:Rhinolophus bat coronavirus HKU2 759:Miniopterus bat coronavirus HKU8 223:Common moorhen coronavirus HKU21 65: 1615: 861:Scotophilus bat coronavirus 512 854:Porcine epidemic diarrhea virus 277:(Delta-CoV) is one of the four 1317:Bat SARS-like coronavirus WIV1 1259:Rousettus bat coronavirus HKU9 1096:China Rattus coronavirus HKU24 983:Suncus murinus coronavirus X74 388: 56:. Scale bar indicates 100 nm. 13: 1: 1590:Night heron coronavirus HKU19 955:Sorex araneus coronavirus T14 752:Miniopterus bat coronavirus 1 381: 260:Night heron coronavirus HKU19 1416:Beluga whale coronavirus SW1 1245:Eidolon bat coronavirus C704 1026:Canine coronavirus HuPn-2018 7: 1561:White-eye coronavirus HKU16 359: 244:White-eye coronavirus HKU16 10: 1857: 695:Lucheng Rn rat coronavirus 1710: 1676: 1647: 1625: 1610: 1585: 1574: 1527: 1516: 1499: 1488: 1477: 1440: 1429: 1410: 1399: 1382: 1371: 1360: 1283: 1272: 1239: 1228: 1200:MERS coronavirus EMC/2012 1176: 1165: 1148: 1137: 1071: 1060: 1049: 1006: 995: 978: 967: 950: 939: 913: 902: 885: 874: 848: 837: 811: 800: 783: 772: 746: 735: 718: 707: 690: 679: 662: 651: 625: 614: 597: 586: 575: 560: 514: 371:Sense (molecular biology) 307:. It is in the subfamily 188: 183: 60: 48: 39: 32: 1533:Bulbul coronavirus HKU11 1504:Wigeon coronavirus HKU20 1289:SARS-related coronavirus 1124:Myodes coronavirus 2JL14 216:Bulbul coronavirus HKU11 200:Wigeon coronavirus HKU20 18:Deltacoronavirus (genus) 1554:Munia coronavirus HKU13 602:Bat coronavirus CDPHE15 237:Munia coronavirus HKU13 1453:Avian coronavirus 9203 1387:Goose coronavirus CB17 1195:London1_novel CoV/2012 1182:Hedgehog coronavirus 1 1103:Human coronavirus HKU1 1088:Human coronavirus OC43 919:Human coronavirus NL63 667:Human coronavirus 229E 184:Subgenera and species 1652:Microhyla letovirus 1 1460:Duck coronavirus 2714 631:Bat coronavirus HKU10 413:10.1128/JVI.06540-11 62:Virus classification 376:Veterinary virology 347:bat viral gene pool 50:Electron micrograph 1831:Deltacoronaviruses 1110:Murine coronavirus 1083:Bovine coronavirus 1021:Canine coronavirus 1016:Feline coronavirus 1011:Alphacoronavirus 1 723:Mink coronavirus 1 568:Orthocoronavirinae 464:: Deltacoronavirus 356:new animal hosts. 310:Orthocoronavirinae 165:Orthocoronavirinae 1818: 1817: 1704:Taxon identifiers 1695: 1694: 1672: 1671: 1668: 1667: 1664: 1663: 1660: 1659: 1606: 1605: 1602: 1601: 1598: 1597: 1570: 1569: 1547:Coronavirus HKU15 1512: 1511: 1473: 1472: 1469: 1468: 1446:Avian coronavirus 1425: 1424: 1395: 1394: 1356: 1355: 1352: 1351: 1268: 1267: 1224: 1223: 1161: 1160: 1133: 1132: 1077:Betacoronavirus 1 1045: 1044: 1041: 1040: 991: 990: 963: 962: 935: 934: 898: 897: 870: 869: 833: 832: 796: 795: 768: 767: 731: 730: 703: 702: 675: 674: 647: 646: 610: 609: 516:Higher taxonomy: 270: 269: 230:Coronavirus HKU15 54:coronavirus HKU15 16:(Redirected from 1848: 1811: 1810: 1798: 1797: 1785: 1784: 1772: 1771: 1759: 1758: 1746: 1745: 1744: 1742:Deltacoronavirus 1731: 1730: 1729: 1712:Deltacoronavirus 1699: 1698: 1687: 1645: 1644: 1636: 1635: 1627: 1626: 1612: 1611: 1583: 1582: 1525: 1524: 1497: 1496: 1486: 1485: 1480:Deltacoronavirus 1438: 1437: 1408: 1407: 1380: 1379: 1369: 1368: 1363:Gammacoronavirus 1281: 1280: 1237: 1236: 1174: 1173: 1146: 1145: 1069: 1068: 1058: 1057: 1004: 1003: 976: 975: 948: 947: 911: 910: 883: 882: 846: 845: 809: 808: 781: 780: 744: 743: 716: 715: 688: 687: 660: 659: 623: 622: 595: 594: 584: 583: 578:Alphacoronavirus 562: 561: 504:Taxonomy of the 498: 491: 484: 475: 474: 448: 444: 435: 434: 424: 407:(7): 3995–4008. 392: 274:Deltacoronavirus 177:Deltacoronavirus 70: 69: 44: 34:Deltacoronavirus 30: 29: 27:Genus of viruses 21: 1856: 1855: 1851: 1850: 1849: 1847: 1846: 1845: 1821: 1820: 1819: 1814: 1806: 1801: 1793: 1788: 1780: 1775: 1767: 1762: 1754: 1749: 1740: 1739: 1734: 1725: 1724: 1719: 1706: 1696: 1691: 1656: 1621: 1594: 1566: 1508: 1465: 1421: 1391: 1348: 1264: 1220: 1157: 1129: 1116:Rat coronavirus 1052:Betacoronavirus 1037: 987: 959: 931: 894: 866: 829: 792: 764: 727: 699: 671: 643: 606: 571: 556: 549:Cornidovirineae 537:Pisoniviricetes 510: 502: 457: 452: 451: 445: 438: 393: 389: 384: 362: 329:single-stranded 129:Pisoniviricetes 64: 28: 23: 22: 15: 12: 11: 5: 1854: 1844: 1843: 1838: 1833: 1816: 1815: 1813: 1812: 1799: 1786: 1773: 1760: 1747: 1732: 1716: 1714: 1708: 1707: 1693: 1692: 1677: 1674: 1673: 1670: 1669: 1666: 1665: 1662: 1661: 1658: 1657: 1655: 1654: 1648: 1642: 1633: 1631:Alphaletovirus 1623: 1622: 1608: 1607: 1604: 1603: 1600: 1599: 1596: 1595: 1593: 1592: 1586: 1580: 1572: 1571: 1568: 1567: 1565: 1564: 1557: 1550: 1543: 1536: 1528: 1522: 1514: 1513: 1510: 1509: 1507: 1506: 1500: 1494: 1483: 1475: 1474: 1471: 1470: 1467: 1466: 1464: 1463: 1456: 1449: 1441: 1435: 1427: 1426: 1423: 1422: 1420: 1419: 1411: 1405: 1397: 1396: 1393: 1392: 1390: 1389: 1383: 1377: 1366: 1358: 1357: 1354: 1353: 1350: 1349: 1347: 1346: 1345: 1344: 1339: 1334: 1329: 1324: 1319: 1314: 1309: 1308: 1307: 1297: 1284: 1278: 1270: 1269: 1266: 1265: 1263: 1262: 1255: 1248: 1240: 1234: 1226: 1225: 1222: 1221: 1219: 1218: 1211: 1204: 1203: 1202: 1197: 1185: 1177: 1171: 1163: 1162: 1159: 1158: 1156: 1155: 1149: 1143: 1135: 1134: 1131: 1130: 1128: 1127: 1120: 1119: 1118: 1106: 1099: 1092: 1091: 1090: 1085: 1072: 1066: 1055: 1047: 1046: 1043: 1042: 1039: 1038: 1036: 1035: 1034: 1033: 1028: 1023: 1018: 1007: 1001: 993: 992: 989: 988: 986: 985: 979: 973: 965: 964: 961: 960: 958: 957: 951: 945: 937: 936: 933: 932: 930: 929: 922: 914: 908: 900: 899: 896: 895: 893: 892: 886: 880: 872: 871: 868: 867: 865: 864: 857: 849: 843: 835: 834: 831: 830: 828: 827: 820: 812: 806: 798: 797: 794: 793: 791: 790: 784: 778: 770: 769: 766: 765: 763: 762: 755: 747: 741: 733: 732: 729: 728: 726: 725: 719: 713: 705: 704: 701: 700: 698: 697: 691: 685: 677: 676: 673: 672: 670: 669: 663: 657: 649: 648: 645: 644: 642: 641: 634: 626: 620: 612: 611: 608: 607: 605: 604: 598: 592: 581: 573: 572: 558: 557: 515: 512: 511: 501: 500: 493: 486: 478: 472: 471: 466: 456: 455:External links 453: 450: 449: 436: 386: 385: 383: 380: 379: 378: 373: 368: 361: 358: 325:positive-sense 313:of the family 268: 267: 266: 265: 264: 263: 249: 248: 247: 240: 233: 226: 219: 205: 204: 203: 186: 185: 181: 180: 173: 169: 168: 161: 157: 156: 149: 145: 144: 137: 133: 132: 125: 121: 120: 113: 109: 108: 101: 97: 96: 89: 82: 81: 76: 72: 71: 58: 57: 46: 45: 37: 36: 26: 9: 6: 4: 3: 2: 1853: 1842: 1841:Coronaviruses 1839: 1837: 1834: 1832: 1829: 1828: 1826: 1809: 1804: 1800: 1796: 1791: 1787: 1783: 1778: 1774: 1770: 1765: 1761: 1757: 1752: 1748: 1743: 1737: 1733: 1728: 1722: 1718: 1717: 1715: 1713: 1709: 1705: 1700: 1690: 1686: 1681: 1675: 1653: 1650: 1649: 1646: 1643: 1641: 1637: 1634: 1632: 1628: 1624: 1620: 1619: 1613: 1609: 1591: 1588: 1587: 1584: 1581: 1579: 1578: 1573: 1563: 1562: 1558: 1556: 1555: 1551: 1549: 1548: 1544: 1542: 1541: 1537: 1535: 1534: 1530: 1529: 1526: 1523: 1521: 1520: 1515: 1505: 1502: 1501: 1498: 1495: 1493: 1492: 1487: 1484: 1482: 1481: 1476: 1462: 1461: 1457: 1455: 1454: 1450: 1448: 1447: 1443: 1442: 1439: 1436: 1434: 1433: 1428: 1418: 1417: 1413: 1412: 1409: 1406: 1404: 1403: 1398: 1388: 1385: 1384: 1381: 1378: 1376: 1375: 1374:Brangacovirus 1370: 1367: 1365: 1364: 1359: 1343: 1340: 1338: 1335: 1333: 1330: 1328: 1325: 1323: 1320: 1318: 1315: 1313: 1310: 1306: 1303: 1302: 1301: 1298: 1296: 1293: 1292: 1291: 1290: 1286: 1285: 1282: 1279: 1277: 1276: 1271: 1261: 1260: 1256: 1254: 1253: 1249: 1247: 1246: 1242: 1241: 1238: 1235: 1233: 1232: 1227: 1217: 1216: 1212: 1210: 1209: 1205: 1201: 1198: 1196: 1193: 1192: 1191: 1190: 1186: 1184: 1183: 1179: 1178: 1175: 1172: 1170: 1169: 1164: 1154: 1151: 1150: 1147: 1144: 1142: 1141: 1136: 1126: 1125: 1121: 1117: 1114: 1113: 1112: 1111: 1107: 1105: 1104: 1100: 1098: 1097: 1093: 1089: 1086: 1084: 1081: 1080: 1079: 1078: 1074: 1073: 1070: 1067: 1065: 1064: 1059: 1056: 1054: 1053: 1048: 1032: 1029: 1027: 1024: 1022: 1019: 1017: 1014: 1013: 1012: 1009: 1008: 1005: 1002: 1000: 999: 994: 984: 981: 980: 977: 974: 972: 971: 966: 956: 953: 952: 949: 946: 944: 943: 938: 928: 927: 923: 921: 920: 916: 915: 912: 909: 907: 906: 901: 891: 888: 887: 884: 881: 879: 878: 873: 863: 862: 858: 856: 855: 851: 850: 847: 844: 842: 841: 836: 826: 825: 821: 819: 818: 814: 813: 810: 807: 805: 804: 799: 789: 786: 785: 782: 779: 777: 776: 771: 761: 760: 756: 754: 753: 749: 748: 745: 742: 740: 739: 738:Minunacovirus 734: 724: 721: 720: 717: 714: 712: 711: 706: 696: 693: 692: 689: 686: 684: 683: 678: 668: 665: 664: 661: 658: 656: 655: 654:Duvinacovirus 650: 640: 639: 635: 633: 632: 628: 627: 624: 621: 619: 618: 613: 603: 600: 599: 596: 593: 591: 590: 585: 582: 580: 579: 574: 570: 569: 563: 559: 555: 554:Coronaviridae 551: 550: 545: 544: 539: 538: 533: 532: 527: 526: 525:Orthornavirae 521: 520: 513: 509: 508: 507:Coronaviridae 499: 494: 492: 487: 485: 480: 479: 476: 470: 467: 465: 463: 459: 458: 443: 441: 432: 428: 423: 418: 414: 410: 406: 402: 398: 391: 387: 377: 374: 372: 369: 367: 364: 363: 357: 354: 353:Recombination 350: 348: 343: 341: 337: 333: 330: 326: 322: 318: 317: 316:Coronaviridae 312: 311: 306: 305:coronaviruses 302: 298: 297: 292: 291: 286: 285: 280: 276: 275: 262: 261: 257: 256: 255: 254: 250: 246: 245: 241: 239: 238: 234: 232: 231: 227: 225: 224: 220: 218: 217: 213: 212: 211: 210: 206: 202: 201: 197: 196: 195: 194: 190: 189: 187: 182: 179: 178: 174: 171: 170: 167: 166: 162: 159: 158: 155: 154: 153:Coronaviridae 150: 147: 146: 143: 142: 138: 135: 134: 131: 130: 126: 123: 122: 119: 118: 114: 111: 110: 107: 106: 105:Orthornavirae 102: 99: 98: 95: 94: 90: 87: 84: 83: 80: 77: 74: 73: 68: 63: 59: 55: 51: 47: 43: 38: 35: 31: 19: 1836:Virus genera 1711: 1651: 1639: 1630: 1616: 1589: 1577:Herdecovirus 1575: 1559: 1552: 1545: 1538: 1531: 1519:Buldecovirus 1517: 1503: 1489: 1479: 1478: 1458: 1451: 1444: 1430: 1414: 1400: 1386: 1372: 1361: 1287: 1275:Sarbecovirus 1273: 1257: 1250: 1243: 1229: 1213: 1206: 1187: 1180: 1168:Merbecovirus 1166: 1152: 1138: 1122: 1108: 1101: 1094: 1075: 1061: 1050: 1010: 996: 982: 968: 954: 940: 924: 917: 905:Setracovirus 903: 889: 877:Rhinacovirus 875: 859: 852: 838: 822: 815: 803:Nyctacovirus 801: 787: 775:Myotacovirus 773: 757: 750: 736: 722: 708: 694: 682:Luchacovirus 680: 666: 652: 636: 629: 615: 601: 587: 576: 566: 553: 547: 541: 535: 531:Pisuviricota 529: 523: 517: 505: 461: 404: 400: 390: 351: 344: 314: 308: 300: 294: 288: 282: 273: 272: 271: 258: 253:Herdecovirus 251: 242: 235: 228: 221: 214: 209:Buldecovirus 207: 198: 191: 176: 175: 164: 152: 140: 128: 117:Pisuviricota 116: 104: 92: 85: 75:(unranked): 33: 1736:Wikispecies 1689:Wikispecies 1640:Milecovirus 1618:Letovirinae 1491:Andecovirus 1402:Cegacovirus 1231:Nobecovirus 1140:Hibecovirus 1063:Embecovirus 998:Tegacovirus 970:Sunacovirus 942:Soracovirus 840:Pedacovirus 710:Minacovirus 617:Decacovirus 589:Colacovirus 543:Nidovirales 332:RNA viruses 319:. They are 193:Andecovirus 160:Subfamily: 141:Nidovirales 1825:Categories 1432:Igacovirus 1342:SHC014-CoV 1300:SARS-CoV-2 1295:SARS-CoV-1 382:References 1727:Q16955738 519:Riboviria 462:Viralzone 366:RNA virus 338:and some 321:enveloped 100:Kingdom: 93:Riboviria 1782:11903959 1769:10369784 1721:Wikidata 1678:Source: 1322:RacCS203 1312:BANAL-52 1305:Variants 431:22278237 401:J. Virol 360:See also 148:Family: 112:Phylum: 1795:1159901 422:3302495 340:mammals 172:Genus: 136:Order: 124:Class: 1808:734212 1337:RpYN06 1332:RmYN02 1327:RaTG13 429:  419:  301:Delta- 299:, and 296:Gamma- 284:Alpha- 279:genera 1803:WoRMS 1777:IRMNG 552:> 546:> 540:> 534:> 528:> 522:> 336:birds 303:) of 290:Beta- 86:Realm 79:Virus 1790:NCBI 1764:GBIF 1756:42RJ 1680:ICTV 427:PMID 1751:CoL 1682:–– 417:PMC 409:doi 52:of 1827:: 1805:: 1792:: 1779:: 1766:: 1753:: 1738:: 1723:: 439:^ 425:. 415:. 405:86 403:. 399:. 342:. 327:, 323:, 293:, 287:, 88:: 497:e 490:t 483:v 433:. 411:: 281:( 20:)

Index

Deltacoronavirus (genus)

Electron micrograph
coronavirus HKU15
Virus classification
Edit this classification
Virus
Riboviria
Orthornavirae
Pisuviricota
Pisoniviricetes
Nidovirales
Coronaviridae
Orthocoronavirinae
Andecovirus
Wigeon coronavirus HKU20
Buldecovirus
Bulbul coronavirus HKU11
Common moorhen coronavirus HKU21
Coronavirus HKU15
Munia coronavirus HKU13
White-eye coronavirus HKU16
Herdecovirus
Night heron coronavirus HKU19
genera
Alpha-
Beta-
Gamma-
coronaviruses
Orthocoronavirinae

Text is available under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License. Additional terms may apply.